Tubaka valgekärbes (bemisia tabaci) on kogu maailmas levinud kahjulik kahjur, millel võib olla tõsine mõju köögiviljakasvatusele. Selle vastupidavus põllukultuuride kaitsele on praktikas üks raskusi. Seetõttu võib resistentsusgeeni mutatsioonide tuvastamine olla kahjurite tõrjeks oluline viide. Üksik Bemisia tabaci on aga väike, kehapikkusega alla 1 mm. Traditsiooniline ühe peaga sekveneerimisoperatsioon on keeruline ja sageli saadakse väike kogus gDNA-d, kuid see kulutab palju aega ja ressursse ning teadusuuringutes on hädasti vaja uusi avastamismeetodeid.
© Tomasz Klejdysz | Dreamstime.com
Köögiviljakahjurite uurimislabor on amplikonitehnoloogia abil välja töötanud meetodi mikro-putukate geenimutatsioonide esinemissageduse tuvastamiseks ja tuvastanud Bemisia tabaci populatsioonis kahe püretroid-resistentsusega seotud punktmutatsiooni sageduse. Meetod on tõhus ja usaldusväärne ning lahendab mikroputukate geenimutatsiooni sageduse tuvastamise probleemi.
Amplikonide sekveneerimist kasutati algselt mulla, taimede või loomade soolestiku mikroobide koosluse tuvastamiseks, mida saab kasutada mikroobide ning loomade ja taimede vahelise koostoime analüüsimiseks. Amplikoni sekveneerimismeetod põhineb järgmise põlvkonna sekveneerimistehnoloogial, millel on kõrge sekveneerimisefektiivsus ja mis suudab teostada suure hulga proovide tsentraliseeritud tuvastamist.
Meeskond lõi tõhusa lähenemisviisi mutatsioonide sageduse tuvastamiseks amplikonide sekveneerimise abil. Selles uuringus tuvastati L925I ja T929V sagedused VGSC -s, mis on seotud püretroidresistentsusega, mis võib anda alusandmeid B. tabaci resistentsuse juhtimiseks.
See uuring annab tõhusa ja usaldusväärse meetodi mikroputukate geenimutatsioonide sageduse tuvastamiseks ning on abiks kahjuritõrje arendamisel põllul. Uuring avaldati Hiina Teaduste Akadeemia esimeses kvartalis entomoloogia eriajakirjas Pest Management Science (mõjufaktor 3.75). Lõputöö esimene autor on labori järeldoktorant Wei Yiyun. Osas tööst osalesid kaasuurijad Wang Ran, dr Qu Cheng ja dr Guan Fang Nanjingi põllumajandusülikoolist. Uurija Luo Chen on artikli vastav autor.
Wei, Y., Guan, F., Wang, R., Qu, C. ja Luo, C. (2021), Ampliconi sekveneerimine tuvastab mutatsioonid, mis on seotud püretroidresistentsusega Bemisia tabaci (Hemiptera: Aleyrodidae). Pest Manag
Avaldamise kuupäev: